Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VPS72Q15906 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
VPS72Q15906 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
VPS72Q15906 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS72Q15906 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS72Q15906 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS72Q15906 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS72Q15906 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS72Q15906 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS72Q15906 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS72Q15906 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS72Q15906 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS72Q15906 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS72Q15906 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS72Q15906 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS72Q15906 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS72Q15906 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS72Q15906 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS72Q15906 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS72Q15906 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS72Q15906 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS72Q15906 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS72Q15906 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS72Q15906 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS72Q15906 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS72Q15906 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS72Q15906 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS72Q15906 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS72Q15906 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS72Q15906 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS72Q15906 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS72Q15906 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS72Q15906 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS72Q15906 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS72Q15906 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS72Q15906 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS72Q15906 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS72Q15906 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS72Q15906 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS72Q15906 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS72Q15906 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS72Q15906 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS72Q15906 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS72Q15906 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
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