Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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NEDD8Q15843 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEDD8Q15843 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
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