Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

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Length 529 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHRNA2Q15822 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHRNA2Q15822 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHRNA2Q15822 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHRNA2Q15822 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHRNA2Q15822 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHRNA2Q15822 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHRNA2Q15822 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHRNA2Q15822 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHRNA2Q15822 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHRNA2Q15822 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHRNA2Q15822 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHRNA2Q15822 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHRNA2Q15822 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHRNA2Q15822 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHRNA2Q15822 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHRNA2Q15822 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHRNA2Q15822 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHRNA2Q15822 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHRNA2Q15822 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHRNA2Q15822 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRNA2Q15822 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRNA2Q15822 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRNA2Q15822 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRNA2Q15822 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRNA2Q15822 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRNA2Q15822 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRNA2Q15822 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRNA2Q15822 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRNA2Q15822 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRNA2Q15822 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRNA2Q15822 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRNA2Q15822 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRNA2Q15822 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRNA2Q15822 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRNA2Q15822 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRNA2Q15822 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRNA2Q15822 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRNA2Q15822 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRNA2Q15822 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRNA2Q15822 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRNA2Q15822 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRNA2Q15822 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRNA2Q15822 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRNA2Q15822 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRNA2Q15822 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRNA2Q15822 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRNA2Q15822 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRNA2Q15822 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRNA2Q15822 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRNA2Q15822 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRNA2Q15822 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRNA2Q15822 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRNA2Q15822 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRNA2Q15822 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRNA2Q15822 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRNA2Q15822 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRNA2Q15822 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRNA2Q15822 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRNA2Q15822 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRNA2Q15822 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRNA2Q15822 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRNA2Q15822 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRNA2Q15822 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRNA2Q15822 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRNA2Q15822 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRNA2Q15822 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRNA2Q15822 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRNA2Q15822 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRNA2Q15822 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRNA2Q15822 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRNA2Q15822 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRNA2Q15822 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRNA2Q15822 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHRNA2Q15822 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHRNA2Q15822 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHRNA2Q15822 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHRNA2Q15822 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHRNA2Q15822 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHRNA2Q15822 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHRNA2Q15822 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHRNA2Q15822 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHRNA2Q15822 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHRNA2Q15822 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CHRNA2Q15822 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHRNA2Q15822 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHRNA2Q15822 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CHRNA2Q15822 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHRNA2Q15822 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHRNA2Q15822 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHRNA2Q15822 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHRNA2Q15822 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHRNA2Q15822 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHRNA2Q15822 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHRNA2Q15822 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHRNA2Q15822 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHRNA2Q15822 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHRNA2Q15822 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHRNA2Q15822 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHRNA2Q15822 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
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