Protein–RNA interactions for Protein: Q15672

TWIST1, Twist-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST1Q15672 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TWIST1Q15672 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms