Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SEC23BQ15437 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
SEC23BQ15437 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SEC23BQ15437 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SEC23BQ15437 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SEC23BQ15437 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEC23BQ15437 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEC23BQ15437 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEC23BQ15437 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEC23BQ15437 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEC23BQ15437 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEC23BQ15437 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEC23BQ15437 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEC23BQ15437 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEC23BQ15437 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEC23BQ15437 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEC23BQ15437 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEC23BQ15437 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEC23BQ15437 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEC23BQ15437 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEC23BQ15437 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEC23BQ15437 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEC23BQ15437 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEC23BQ15437 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEC23BQ15437 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEC23BQ15437 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEC23BQ15437 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEC23BQ15437 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SEC23BQ15437 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEC23BQ15437 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEC23BQ15437 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEC23BQ15437 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEC23BQ15437 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEC23BQ15437 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEC23BQ15437 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEC23BQ15437 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEC23BQ15437 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEC23BQ15437 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEC23BQ15437 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEC23BQ15437 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEC23BQ15437 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEC23BQ15437 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
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SEC23BQ15437 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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SEC23BQ15437 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEC23BQ15437 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEC23BQ15437 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
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SEC23BQ15437 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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SEC23BQ15437 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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SEC23BQ15437 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
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SEC23BQ15437 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SEC23BQ15437 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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SEC23BQ15437 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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SEC23BQ15437 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEC23BQ15437 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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SEC23BQ15437 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEC23BQ15437 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEC23BQ15437 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEC23BQ15437 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEC23BQ15437 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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SEC23BQ15437 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEC23BQ15437 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEC23BQ15437 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SEC23BQ15437 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEC23BQ15437 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEC23BQ15437 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEC23BQ15437 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEC23BQ15437 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEC23BQ15437 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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