Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,024 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PCM1Q15154 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PCM1Q15154 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PCM1Q15154 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PCM1Q15154 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PCM1Q15154 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCM1Q15154 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms