Protein–RNA interactions for Protein: Q15139

PRKD1, Serine/threonine-protein kinase D1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD1Q15139 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
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