Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NCF4Q15080 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms