Protein–RNA interactions for Protein: Q14406

CSHL1, Chorionic somatomammotropin hormone-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSHL1Q14406 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms