Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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KLF9Q13886 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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KLF9Q13886 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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KLF9Q13886 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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KLF9Q13886 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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KLF9Q13886 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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KLF9Q13886 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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KLF9Q13886 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
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KLF9Q13886 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
KLF9Q13886 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
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KLF9Q13886 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
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