Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SHROOM2Q13796 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SHROOM2Q13796 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SHROOM2Q13796 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SHROOM2Q13796 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SHROOM2Q13796 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SHROOM2Q13796 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SHROOM2Q13796 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SHROOM2Q13796 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SHROOM2Q13796 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SHROOM2Q13796 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SHROOM2Q13796 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SHROOM2Q13796 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SHROOM2Q13796 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SHROOM2Q13796 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SHROOM2Q13796 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SHROOM2Q13796 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SHROOM2Q13796 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SHROOM2Q13796 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SHROOM2Q13796 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SHROOM2Q13796 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SHROOM2Q13796 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SHROOM2Q13796 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SHROOM2Q13796 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SHROOM2Q13796 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SHROOM2Q13796 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SHROOM2Q13796 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SHROOM2Q13796 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SHROOM2Q13796 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SHROOM2Q13796 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SHROOM2Q13796 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SHROOM2Q13796 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SHROOM2Q13796 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SHROOM2Q13796 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SHROOM2Q13796 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SHROOM2Q13796 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SHROOM2Q13796 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SHROOM2Q13796 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SHROOM2Q13796 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SHROOM2Q13796 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SHROOM2Q13796 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SHROOM2Q13796 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SHROOM2Q13796 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SHROOM2Q13796 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SHROOM2Q13796 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SHROOM2Q13796 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SHROOM2Q13796 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SHROOM2Q13796 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SHROOM2Q13796 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SHROOM2Q13796 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SHROOM2Q13796 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SHROOM2Q13796 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SHROOM2Q13796 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SHROOM2Q13796 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SHROOM2Q13796 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SHROOM2Q13796 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SHROOM2Q13796 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SHROOM2Q13796 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SHROOM2Q13796 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SHROOM2Q13796 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SHROOM2Q13796 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SHROOM2Q13796 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SHROOM2Q13796 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SHROOM2Q13796 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SHROOM2Q13796 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SHROOM2Q13796 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SHROOM2Q13796 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
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SHROOM2Q13796 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SHROOM2Q13796 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SHROOM2Q13796 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
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SHROOM2Q13796 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SHROOM2Q13796 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SHROOM2Q13796 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SHROOM2Q13796 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SHROOM2Q13796 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SHROOM2Q13796 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SHROOM2Q13796 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SHROOM2Q13796 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.56■■■□□ 2
SHROOM2Q13796 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SHROOM2Q13796 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SHROOM2Q13796 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
SHROOM2Q13796 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SHROOM2Q13796 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
SHROOM2Q13796 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SHROOM2Q13796 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
SHROOM2Q13796 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SHROOM2Q13796 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SHROOM2Q13796 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SHROOM2Q13796 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SHROOM2Q13796 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SHROOM2Q13796 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SHROOM2Q13796 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SHROOM2Q13796 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SHROOM2Q13796 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SHROOM2Q13796 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SHROOM2Q13796 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SHROOM2Q13796 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
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