Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOFQ13790 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOFQ13790 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOFQ13790 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOFQ13790 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOFQ13790 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOFQ13790 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOFQ13790 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOFQ13790 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOFQ13790 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
APOFQ13790 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOFQ13790 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOFQ13790 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOFQ13790 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOFQ13790 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOFQ13790 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOFQ13790 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOFQ13790 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOFQ13790 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOFQ13790 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
APOFQ13790 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOFQ13790 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOFQ13790 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOFQ13790 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOFQ13790 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
APOFQ13790 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOFQ13790 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOFQ13790 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOFQ13790 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOFQ13790 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOFQ13790 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOFQ13790 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOFQ13790 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
APOFQ13790 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOFQ13790 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOFQ13790 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOFQ13790 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOFQ13790 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOFQ13790 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOFQ13790 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
APOFQ13790 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOFQ13790 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOFQ13790 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOFQ13790 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOFQ13790 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOFQ13790 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOFQ13790 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOFQ13790 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOFQ13790 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
APOFQ13790 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOFQ13790 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOFQ13790 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOFQ13790 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOFQ13790 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOFQ13790 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOFQ13790 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOFQ13790 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOFQ13790 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOFQ13790 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOFQ13790 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOFQ13790 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOFQ13790 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOFQ13790 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOFQ13790 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOFQ13790 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOFQ13790 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOFQ13790 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOFQ13790 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOFQ13790 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
APOFQ13790 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOFQ13790 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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APOFQ13790 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOFQ13790 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
APOFQ13790 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOFQ13790 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOFQ13790 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOFQ13790 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOFQ13790 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOFQ13790 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOFQ13790 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOFQ13790 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOFQ13790 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOFQ13790 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOFQ13790 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOFQ13790 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOFQ13790 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOFQ13790 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOFQ13790 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOFQ13790 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOFQ13790 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOFQ13790 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOFQ13790 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOFQ13790 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOFQ13790 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOFQ13790 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOFQ13790 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOFQ13790 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOFQ13790 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOFQ13790 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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