Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FHL3Q13643 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FHL3Q13643 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms