Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PEX6Q13608 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms