Protein–RNA interactions for Protein: Q13573

SNW1, SNW domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNW1Q13573 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNW1Q13573 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNW1Q13573 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNW1Q13573 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNW1Q13573 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNW1Q13573 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNW1Q13573 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNW1Q13573 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNW1Q13573 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNW1Q13573 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNW1Q13573 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNW1Q13573 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SNW1Q13573 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNW1Q13573 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNW1Q13573 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNW1Q13573 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNW1Q13573 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNW1Q13573 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNW1Q13573 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNW1Q13573 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNW1Q13573 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNW1Q13573 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNW1Q13573 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNW1Q13573 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNW1Q13573 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNW1Q13573 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNW1Q13573 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNW1Q13573 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNW1Q13573 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNW1Q13573 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNW1Q13573 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNW1Q13573 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNW1Q13573 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNW1Q13573 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNW1Q13573 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNW1Q13573 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNW1Q13573 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNW1Q13573 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNW1Q13573 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNW1Q13573 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNW1Q13573 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNW1Q13573 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNW1Q13573 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNW1Q13573 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNW1Q13573 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNW1Q13573 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNW1Q13573 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNW1Q13573 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNW1Q13573 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNW1Q13573 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNW1Q13573 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNW1Q13573 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNW1Q13573 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNW1Q13573 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNW1Q13573 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SNW1Q13573 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNW1Q13573 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SNW1Q13573 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNW1Q13573 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNW1Q13573 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNW1Q13573 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNW1Q13573 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNW1Q13573 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNW1Q13573 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNW1Q13573 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNW1Q13573 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNW1Q13573 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNW1Q13573 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNW1Q13573 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNW1Q13573 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNW1Q13573 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNW1Q13573 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNW1Q13573 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNW1Q13573 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNW1Q13573 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNW1Q13573 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SNW1Q13573 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNW1Q13573 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNW1Q13573 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNW1Q13573 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNW1Q13573 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNW1Q13573 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SNW1Q13573 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNW1Q13573 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNW1Q13573 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNW1Q13573 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNW1Q13573 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNW1Q13573 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNW1Q13573 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNW1Q13573 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNW1Q13573 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNW1Q13573 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNW1Q13573 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNW1Q13573 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNW1Q13573 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNW1Q13573 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNW1Q13573 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNW1Q13573 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNW1Q13573 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SNW1Q13573 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms