Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
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NAE1Q13564 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
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NAE1Q13564 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
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NAE1Q13564 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NAE1Q13564 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms