Protein–RNA interactions for Protein: Q13491

GPM6B, Neuronal membrane glycoprotein M6-b, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPM6BQ13491 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPM6BQ13491 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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