Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SGCGQ13326 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
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