Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATMQ13315 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATMQ13315 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATMQ13315 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATMQ13315 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
ATMQ13315 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
ATMQ13315 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.14
ATMQ13315 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATMQ13315 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATMQ13315 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATMQ13315 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATMQ13315 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATMQ13315 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATMQ13315 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ATMQ13315 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ATMQ13315 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ATMQ13315 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATMQ13315 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATMQ13315 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATMQ13315 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATMQ13315 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATMQ13315 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATMQ13315 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ATMQ13315 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATMQ13315 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATMQ13315 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATMQ13315 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATMQ13315 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATMQ13315 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ATMQ13315 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATMQ13315 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATMQ13315 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATMQ13315 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ATMQ13315 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ATMQ13315 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATMQ13315 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATMQ13315 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATMQ13315 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ATMQ13315 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATMQ13315 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATMQ13315 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATMQ13315 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATMQ13315 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATMQ13315 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATMQ13315 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATMQ13315 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATMQ13315 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATMQ13315 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATMQ13315 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATMQ13315 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATMQ13315 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATMQ13315 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATMQ13315 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATMQ13315 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATMQ13315 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATMQ13315 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATMQ13315 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATMQ13315 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATMQ13315 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATMQ13315 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATMQ13315 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATMQ13315 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATMQ13315 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATMQ13315 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATMQ13315 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATMQ13315 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATMQ13315 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATMQ13315 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ATMQ13315 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATMQ13315 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATMQ13315 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATMQ13315 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATMQ13315 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATMQ13315 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATMQ13315 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATMQ13315 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ATMQ13315 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATMQ13315 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ATMQ13315 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATMQ13315 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATMQ13315 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATMQ13315 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATMQ13315 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATMQ13315 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATMQ13315 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATMQ13315 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATMQ13315 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATMQ13315 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ATMQ13315 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATMQ13315 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATMQ13315 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATMQ13315 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATMQ13315 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATMQ13315 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATMQ13315 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATMQ13315 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATMQ13315 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATMQ13315 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATMQ13315 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATMQ13315 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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