Protein–RNA interactions for Protein: Q13291

SLAMF1, Signaling lymphocytic activation molecule, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAMF1Q13291 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLAMF1Q13291 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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