Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

Predictions only

Length 1,484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GRIN2BQ13224 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GRIN2BQ13224 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GRIN2BQ13224 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
GRIN2BQ13224 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GRIN2BQ13224 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GRIN2BQ13224 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GRIN2BQ13224 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GRIN2BQ13224 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
GRIN2BQ13224 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GRIN2BQ13224 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GRIN2BQ13224 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GRIN2BQ13224 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GRIN2BQ13224 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GRIN2BQ13224 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GRIN2BQ13224 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GRIN2BQ13224 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GRIN2BQ13224 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GRIN2BQ13224 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GRIN2BQ13224 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GRIN2BQ13224 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GRIN2BQ13224 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GRIN2BQ13224 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
GRIN2BQ13224 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
GRIN2BQ13224 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GRIN2BQ13224 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GRIN2BQ13224 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GRIN2BQ13224 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GRIN2BQ13224 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
GRIN2BQ13224 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GRIN2BQ13224 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GRIN2BQ13224 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GRIN2BQ13224 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GRIN2BQ13224 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GRIN2BQ13224 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GRIN2BQ13224 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GRIN2BQ13224 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GRIN2BQ13224 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GRIN2BQ13224 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GRIN2BQ13224 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GRIN2BQ13224 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GRIN2BQ13224 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GRIN2BQ13224 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GRIN2BQ13224 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GRIN2BQ13224 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GRIN2BQ13224 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GRIN2BQ13224 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GRIN2BQ13224 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GRIN2BQ13224 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GRIN2BQ13224 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GRIN2BQ13224 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GRIN2BQ13224 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GRIN2BQ13224 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GRIN2BQ13224 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GRIN2BQ13224 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
GRIN2BQ13224 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GRIN2BQ13224 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
GRIN2BQ13224 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
GRIN2BQ13224 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
GRIN2BQ13224 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
GRIN2BQ13224 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
GRIN2BQ13224 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GRIN2BQ13224 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
GRIN2BQ13224 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
GRIN2BQ13224 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GRIN2BQ13224 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GRIN2BQ13224 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
GRIN2BQ13224 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GRIN2BQ13224 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
GRIN2BQ13224 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GRIN2BQ13224 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GRIN2BQ13224 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
GRIN2BQ13224 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
GRIN2BQ13224 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GRIN2BQ13224 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GRIN2BQ13224 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GRIN2BQ13224 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GRIN2BQ13224 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GRIN2BQ13224 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GRIN2BQ13224 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GRIN2BQ13224 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GRIN2BQ13224 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
GRIN2BQ13224 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GRIN2BQ13224 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GRIN2BQ13224 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GRIN2BQ13224 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
GRIN2BQ13224 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GRIN2BQ13224 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GRIN2BQ13224 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GRIN2BQ13224 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GRIN2BQ13224 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GRIN2BQ13224 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GRIN2BQ13224 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GRIN2BQ13224 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GRIN2BQ13224 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GRIN2BQ13224 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
GRIN2BQ13224 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GRIN2BQ13224 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GRIN2BQ13224 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GRIN2BQ13224 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms