Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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CSTF3Q12996 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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CSTF3Q12996 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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CSTF3Q12996 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSTF3Q12996 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms