Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NPRL3Q12980 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms