Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
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PTPRJQ12913 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRJQ12913 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRJQ12913 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRJQ12913 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRJQ12913 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
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PTPRJQ12913 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRJQ12913 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRJQ12913 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRJQ12913 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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PTPRJQ12913 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRJQ12913 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRJQ12913 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRJQ12913 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRJQ12913 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRJQ12913 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRJQ12913 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
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PTPRJQ12913 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
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PTPRJQ12913 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRJQ12913 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRJQ12913 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRJQ12913 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRJQ12913 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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PTPRJQ12913 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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PTPRJQ12913 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRJQ12913 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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PTPRJQ12913 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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PTPRJQ12913 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRJQ12913 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRJQ12913 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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PTPRJQ12913 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRJQ12913 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRJQ12913 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRJQ12913 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRJQ12913 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRJQ12913 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRJQ12913 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRJQ12913 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRJQ12913 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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