Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CNTN1Q12860 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CNTN1Q12860 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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