Protein–RNA interactions for Protein: Q12840

KIF5A, Kinesin heavy chain isoform 5A, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF5AQ12840 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KIF5AQ12840 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
KIF5AQ12840 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KIF5AQ12840 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KIF5AQ12840 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KIF5AQ12840 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KIF5AQ12840 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KIF5AQ12840 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KIF5AQ12840 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KIF5AQ12840 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KIF5AQ12840 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KIF5AQ12840 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KIF5AQ12840 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KIF5AQ12840 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KIF5AQ12840 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
KIF5AQ12840 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KIF5AQ12840 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KIF5AQ12840 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KIF5AQ12840 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KIF5AQ12840 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KIF5AQ12840 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KIF5AQ12840 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KIF5AQ12840 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KIF5AQ12840 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KIF5AQ12840 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KIF5AQ12840 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KIF5AQ12840 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KIF5AQ12840 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KIF5AQ12840 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KIF5AQ12840 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KIF5AQ12840 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KIF5AQ12840 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KIF5AQ12840 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KIF5AQ12840 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
KIF5AQ12840 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KIF5AQ12840 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KIF5AQ12840 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KIF5AQ12840 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KIF5AQ12840 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KIF5AQ12840 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KIF5AQ12840 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KIF5AQ12840 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KIF5AQ12840 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KIF5AQ12840 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KIF5AQ12840 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KIF5AQ12840 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KIF5AQ12840 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KIF5AQ12840 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KIF5AQ12840 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KIF5AQ12840 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KIF5AQ12840 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KIF5AQ12840 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KIF5AQ12840 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KIF5AQ12840 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KIF5AQ12840 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KIF5AQ12840 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KIF5AQ12840 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KIF5AQ12840 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KIF5AQ12840 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KIF5AQ12840 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KIF5AQ12840 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KIF5AQ12840 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KIF5AQ12840 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KIF5AQ12840 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KIF5AQ12840 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KIF5AQ12840 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KIF5AQ12840 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KIF5AQ12840 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
KIF5AQ12840 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KIF5AQ12840 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KIF5AQ12840 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KIF5AQ12840 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KIF5AQ12840 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KIF5AQ12840 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KIF5AQ12840 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KIF5AQ12840 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KIF5AQ12840 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KIF5AQ12840 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KIF5AQ12840 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KIF5AQ12840 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KIF5AQ12840 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KIF5AQ12840 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KIF5AQ12840 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KIF5AQ12840 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KIF5AQ12840 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KIF5AQ12840 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KIF5AQ12840 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
KIF5AQ12840 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KIF5AQ12840 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KIF5AQ12840 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KIF5AQ12840 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KIF5AQ12840 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KIF5AQ12840 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
KIF5AQ12840 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KIF5AQ12840 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KIF5AQ12840 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KIF5AQ12840 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
KIF5AQ12840 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KIF5AQ12840 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KIF5AQ12840 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms