Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CGNL1Q0VF96 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CGNL1Q0VF96 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CGNL1Q0VF96 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CGNL1Q0VF96 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
CGNL1Q0VF96 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CGNL1Q0VF96 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CGNL1Q0VF96 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CGNL1Q0VF96 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CGNL1Q0VF96 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
CGNL1Q0VF96 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
CGNL1Q0VF96 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CGNL1Q0VF96 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CGNL1Q0VF96 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CGNL1Q0VF96 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CGNL1Q0VF96 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CGNL1Q0VF96 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CGNL1Q0VF96 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CGNL1Q0VF96 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CGNL1Q0VF96 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CGNL1Q0VF96 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CGNL1Q0VF96 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CGNL1Q0VF96 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CGNL1Q0VF96 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CGNL1Q0VF96 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CGNL1Q0VF96 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CGNL1Q0VF96 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CGNL1Q0VF96 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CGNL1Q0VF96 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CGNL1Q0VF96 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CGNL1Q0VF96 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CGNL1Q0VF96 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CGNL1Q0VF96 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CGNL1Q0VF96 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CGNL1Q0VF96 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CGNL1Q0VF96 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CGNL1Q0VF96 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CGNL1Q0VF96 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CGNL1Q0VF96 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CGNL1Q0VF96 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CGNL1Q0VF96 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CGNL1Q0VF96 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CGNL1Q0VF96 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CGNL1Q0VF96 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CGNL1Q0VF96 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CGNL1Q0VF96 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CGNL1Q0VF96 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CGNL1Q0VF96 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CGNL1Q0VF96 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CGNL1Q0VF96 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CGNL1Q0VF96 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CGNL1Q0VF96 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CGNL1Q0VF96 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CGNL1Q0VF96 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CGNL1Q0VF96 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CGNL1Q0VF96 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CGNL1Q0VF96 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CGNL1Q0VF96 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CGNL1Q0VF96 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CGNL1Q0VF96 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CGNL1Q0VF96 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CGNL1Q0VF96 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CGNL1Q0VF96 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CGNL1Q0VF96 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CGNL1Q0VF96 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CGNL1Q0VF96 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CGNL1Q0VF96 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CGNL1Q0VF96 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CGNL1Q0VF96 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CGNL1Q0VF96 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CGNL1Q0VF96 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CGNL1Q0VF96 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CGNL1Q0VF96 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms