Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RASGEF1BQ0VAM2 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms