Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC15Q0P6D6 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms