Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NIPAL4Q0D2K0 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms