Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NCBP1Q09161 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms