Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI8

C2orf54, Uncharacterized protein C2orf54, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf54Q08AI8 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C2orf54Q08AI8 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C2orf54Q08AI8 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
C2orf54Q08AI8 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C2orf54Q08AI8 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C2orf54Q08AI8 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C2orf54Q08AI8 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C2orf54Q08AI8 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
C2orf54Q08AI8 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C2orf54Q08AI8 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C2orf54Q08AI8 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C2orf54Q08AI8 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
C2orf54Q08AI8 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C2orf54Q08AI8 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C2orf54Q08AI8 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C2orf54Q08AI8 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C2orf54Q08AI8 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
C2orf54Q08AI8 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C2orf54Q08AI8 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C2orf54Q08AI8 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C2orf54Q08AI8 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C2orf54Q08AI8 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C2orf54Q08AI8 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C2orf54Q08AI8 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C2orf54Q08AI8 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C2orf54Q08AI8 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C2orf54Q08AI8 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C2orf54Q08AI8 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C2orf54Q08AI8 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C2orf54Q08AI8 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C2orf54Q08AI8 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C2orf54Q08AI8 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C2orf54Q08AI8 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C2orf54Q08AI8 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C2orf54Q08AI8 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C2orf54Q08AI8 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C2orf54Q08AI8 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C2orf54Q08AI8 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C2orf54Q08AI8 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C2orf54Q08AI8 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C2orf54Q08AI8 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C2orf54Q08AI8 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
C2orf54Q08AI8 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
C2orf54Q08AI8 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C2orf54Q08AI8 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
C2orf54Q08AI8 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C2orf54Q08AI8 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C2orf54Q08AI8 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C2orf54Q08AI8 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C2orf54Q08AI8 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C2orf54Q08AI8 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C2orf54Q08AI8 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C2orf54Q08AI8 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C2orf54Q08AI8 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C2orf54Q08AI8 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C2orf54Q08AI8 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C2orf54Q08AI8 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C2orf54Q08AI8 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C2orf54Q08AI8 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C2orf54Q08AI8 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C2orf54Q08AI8 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C2orf54Q08AI8 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C2orf54Q08AI8 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C2orf54Q08AI8 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C2orf54Q08AI8 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C2orf54Q08AI8 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C2orf54Q08AI8 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C2orf54Q08AI8 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C2orf54Q08AI8 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C2orf54Q08AI8 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C2orf54Q08AI8 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C2orf54Q08AI8 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C2orf54Q08AI8 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C2orf54Q08AI8 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
C2orf54Q08AI8 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C2orf54Q08AI8 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
C2orf54Q08AI8 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C2orf54Q08AI8 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
C2orf54Q08AI8 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C2orf54Q08AI8 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C2orf54Q08AI8 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C2orf54Q08AI8 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C2orf54Q08AI8 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C2orf54Q08AI8 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C2orf54Q08AI8 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C2orf54Q08AI8 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C2orf54Q08AI8 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C2orf54Q08AI8 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C2orf54Q08AI8 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C2orf54Q08AI8 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C2orf54Q08AI8 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C2orf54Q08AI8 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C2orf54Q08AI8 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C2orf54Q08AI8 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C2orf54Q08AI8 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C2orf54Q08AI8 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C2orf54Q08AI8 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C2orf54Q08AI8 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C2orf54Q08AI8 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C2orf54Q08AI8 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms