Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
PDE4DQ08499 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE4DQ08499 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms