Protein–RNA interactions for Protein: Q07092

COL16A1, Collagen alpha-1(XVI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL16A1Q07092 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL16A1Q07092 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL16A1Q07092 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL16A1Q07092 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL16A1Q07092 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
COL16A1Q07092 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms