Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EGR3Q06889 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EGR3Q06889 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms