Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms