Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNEQ04844 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNEQ04844 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms