Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DSC2Q02487 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
DSC2Q02487 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms