Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TNFRSF17Q02223 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNFRSF17Q02223 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms