Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDC42EP1Q00587 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms