Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF2BQ00403 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms