Protein–RNA interactions for Protein: Q00056

HOXA4, Homeobox protein Hox-A4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4Q00056 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXA4Q00056 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXA4Q00056 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXA4Q00056 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXA4Q00056 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXA4Q00056 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXA4Q00056 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXA4Q00056 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXA4Q00056 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXA4Q00056 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXA4Q00056 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXA4Q00056 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXA4Q00056 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXA4Q00056 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXA4Q00056 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXA4Q00056 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXA4Q00056 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXA4Q00056 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXA4Q00056 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXA4Q00056 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXA4Q00056 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXA4Q00056 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXA4Q00056 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXA4Q00056 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXA4Q00056 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXA4Q00056 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXA4Q00056 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXA4Q00056 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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HOXA4Q00056 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXA4Q00056 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXA4Q00056 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXA4Q00056 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXA4Q00056 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXA4Q00056 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXA4Q00056 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXA4Q00056 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXA4Q00056 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXA4Q00056 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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HOXA4Q00056 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXA4Q00056 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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HOXA4Q00056 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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HOXA4Q00056 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXA4Q00056 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXA4Q00056 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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HOXA4Q00056 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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HOXA4Q00056 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
HOXA4Q00056 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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HOXA4Q00056 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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HOXA4Q00056 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXA4Q00056 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXA4Q00056 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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HOXA4Q00056 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXA4Q00056 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXA4Q00056 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXA4Q00056 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXA4Q00056 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXA4Q00056 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXA4Q00056 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXA4Q00056 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXA4Q00056 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXA4Q00056 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXA4Q00056 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXA4Q00056 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXA4Q00056 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXA4Q00056 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXA4Q00056 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXA4Q00056 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXA4Q00056 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXA4Q00056 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXA4Q00056 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXA4Q00056 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXA4Q00056 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXA4Q00056 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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