Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM3AP98173 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3AP98173 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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