Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SKOR1P84550 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKOR1P84550 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms