Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK2A1P68400 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK2A1P68400 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK2A1P68400 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK2A1P68400 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK2A1P68400 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK2A1P68400 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK2A1P68400 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK2A1P68400 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK2A1P68400 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK2A1P68400 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK2A1P68400 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK2A1P68400 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK2A1P68400 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK2A1P68400 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK2A1P68400 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK2A1P68400 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK2A1P68400 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK2A1P68400 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK2A1P68400 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK2A1P68400 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK2A1P68400 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK2A1P68400 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK2A1P68400 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK2A1P68400 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK2A1P68400 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK2A1P68400 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK2A1P68400 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK2A1P68400 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK2A1P68400 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK2A1P68400 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK2A1P68400 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK2A1P68400 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK2A1P68400 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK2A1P68400 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms