Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms