Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
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H2BFSP57053 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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H2BFSP57053 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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