Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NME5P56597 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NME5P56597 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NME5P56597 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NME5P56597 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NME5P56597 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NME5P56597 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NME5P56597 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NME5P56597 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NME5P56597 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NME5P56597 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NME5P56597 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NME5P56597 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NME5P56597 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NME5P56597 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NME5P56597 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NME5P56597 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NME5P56597 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NME5P56597 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NME5P56597 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NME5P56597 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NME5P56597 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NME5P56597 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NME5P56597 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NME5P56597 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NME5P56597 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NME5P56597 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NME5P56597 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NME5P56597 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NME5P56597 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NME5P56597 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NME5P56597 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NME5P56597 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NME5P56597 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NME5P56597 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NME5P56597 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
NME5P56597 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NME5P56597 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NME5P56597 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NME5P56597 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NME5P56597 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NME5P56597 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NME5P56597 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NME5P56597 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NME5P56597 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NME5P56597 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NME5P56597 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NME5P56597 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NME5P56597 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NME5P56597 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NME5P56597 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NME5P56597 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NME5P56597 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NME5P56597 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NME5P56597 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NME5P56597 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NME5P56597 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NME5P56597 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NME5P56597 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NME5P56597 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NME5P56597 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NME5P56597 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NME5P56597 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NME5P56597 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NME5P56597 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NME5P56597 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NME5P56597 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NME5P56597 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NME5P56597 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NME5P56597 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NME5P56597 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NME5P56597 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NME5P56597 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NME5P56597 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NME5P56597 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NME5P56597 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NME5P56597 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NME5P56597 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NME5P56597 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NME5P56597 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NME5P56597 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NME5P56597 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NME5P56597 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NME5P56597 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NME5P56597 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NME5P56597 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NME5P56597 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NME5P56597 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NME5P56597 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NME5P56597 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NME5P56597 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NME5P56597 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NME5P56597 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NME5P56597 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NME5P56597 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NME5P56597 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NME5P56597 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NME5P56597 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NME5P56597 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NME5P56597 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms