Protein–RNA interactions for Protein: P54646

PRKAA2, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA2P54646 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKAA2P54646 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKAA2P54646 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKAA2P54646 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKAA2P54646 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKAA2P54646 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKAA2P54646 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKAA2P54646 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKAA2P54646 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKAA2P54646 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKAA2P54646 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKAA2P54646 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRKAA2P54646 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRKAA2P54646 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRKAA2P54646 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRKAA2P54646 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRKAA2P54646 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRKAA2P54646 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRKAA2P54646 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRKAA2P54646 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRKAA2P54646 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRKAA2P54646 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRKAA2P54646 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRKAA2P54646 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRKAA2P54646 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRKAA2P54646 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRKAA2P54646 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRKAA2P54646 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRKAA2P54646 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRKAA2P54646 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRKAA2P54646 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRKAA2P54646 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRKAA2P54646 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRKAA2P54646 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRKAA2P54646 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRKAA2P54646 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRKAA2P54646 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRKAA2P54646 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRKAA2P54646 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRKAA2P54646 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRKAA2P54646 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRKAA2P54646 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRKAA2P54646 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRKAA2P54646 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PRKAA2P54646 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PRKAA2P54646 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PRKAA2P54646 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PRKAA2P54646 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PRKAA2P54646 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PRKAA2P54646 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PRKAA2P54646 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PRKAA2P54646 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PRKAA2P54646 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRKAA2P54646 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms