Protein–RNA interactions for Protein: P53673

CRYBA4, Beta-crystallin A4, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRYBA4P53673 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CRYBA4P53673 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CRYBA4P53673 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CRYBA4P53673 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CRYBA4P53673 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CRYBA4P53673 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CRYBA4P53673 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CRYBA4P53673 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CRYBA4P53673 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CRYBA4P53673 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CRYBA4P53673 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CRYBA4P53673 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CRYBA4P53673 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CRYBA4P53673 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CRYBA4P53673 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CRYBA4P53673 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CRYBA4P53673 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CRYBA4P53673 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CRYBA4P53673 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CRYBA4P53673 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CRYBA4P53673 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CRYBA4P53673 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CRYBA4P53673 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CRYBA4P53673 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CRYBA4P53673 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CRYBA4P53673 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CRYBA4P53673 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CRYBA4P53673 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CRYBA4P53673 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CRYBA4P53673 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CRYBA4P53673 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CRYBA4P53673 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
CRYBA4P53673 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
CRYBA4P53673 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CRYBA4P53673 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CRYBA4P53673 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CRYBA4P53673 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CRYBA4P53673 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CRYBA4P53673 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CRYBA4P53673 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CRYBA4P53673 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CRYBA4P53673 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CRYBA4P53673 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CRYBA4P53673 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CRYBA4P53673 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CRYBA4P53673 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CRYBA4P53673 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CRYBA4P53673 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CRYBA4P53673 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CRYBA4P53673 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CRYBA4P53673 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CRYBA4P53673 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CRYBA4P53673 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CRYBA4P53673 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CRYBA4P53673 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CRYBA4P53673 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CRYBA4P53673 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CRYBA4P53673 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CRYBA4P53673 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CRYBA4P53673 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CRYBA4P53673 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CRYBA4P53673 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CRYBA4P53673 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CRYBA4P53673 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CRYBA4P53673 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CRYBA4P53673 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CRYBA4P53673 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CRYBA4P53673 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CRYBA4P53673 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CRYBA4P53673 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CRYBA4P53673 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CRYBA4P53673 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CRYBA4P53673 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CRYBA4P53673 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CRYBA4P53673 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CRYBA4P53673 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CRYBA4P53673 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CRYBA4P53673 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CRYBA4P53673 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CRYBA4P53673 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CRYBA4P53673 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CRYBA4P53673 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CRYBA4P53673 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CRYBA4P53673 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CRYBA4P53673 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CRYBA4P53673 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CRYBA4P53673 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CRYBA4P53673 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CRYBA4P53673 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CRYBA4P53673 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CRYBA4P53673 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CRYBA4P53673 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CRYBA4P53673 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CRYBA4P53673 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CRYBA4P53673 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CRYBA4P53673 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CRYBA4P53673 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CRYBA4P53673 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CRYBA4P53673 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CRYBA4P53673 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms